后来玄帝颛顼与水神共工相争，撞倒顶天立地的不周山，致使天塌下来。为了补天，女娲用七彩神石进行补天。而玄帝颛顼在火神祝融的帮助下，成功夺得帝位。
天虽然得到补救，但一些邪祟也随之而来。为了将这些邪祟击败，十二祖巫则参与战斗，合力之下，保护了人类，所以世人称他们为祖巫。
东西方之间，有一宝地，为西天极乐世界。佛之祖始为释迦牟尼，掌漫天佛菩萨，令地藏王菩萨执掌地狱鬼门。而地狱鬼门下，便是十殿阎王。
这世间六道为三善道、三恶道。三善道为：天道、人道、阿修罗道。三恶道为：畜生道、饿鬼道和地狱道。
这天道由漫天神佛主宰，人道由道祖、伏羲所掌。阿修罗道则由阿修罗王统御。至于畜生道由凤凰、麒麟主宰，饿鬼道和地狱道由地藏王菩萨主持。所以是上至天庭凌霄殿，下至地府鬼门关。
阿修罗非善非恶，由于嗔恨心中，极为好战，所以也会慢慢堕落。
最后便是东部岛国。相传有一神诞生名为天之御主神。后其创造伊邪那歧和伊邪那美。天为高天原，地为黄泉，人间为苇尾。
由于伊邪兄妹结合生下不少神，而她被生出来的火神烫死。为了见老婆，那歧便去了黄泉。黄泉中，伊邪那美让他等一下自己，但好奇的他还是看了。好奇心害死猫，见到那美真容后，那歧立即吓得跑。为了报复这个负心汉，那美便召集黄泉鬼杀他子民，而那歧也表示杀了再造。
伤心的他于是留下两滴泪，左眼泪为天照大神，右眼泪为月读神。鼻孔出现须佐之男。
天照大神生出了天皇，而须佐之男则斩杀了八歧大蛇。拥有天照大神血脉的天皇统治着人间，而须佐之男则流传了一把草薙剑，此剑便是从大蛇之中取出。
因为这把剑，天照一派想私吞这把剑，便召集众神与须佐一派打了一场，失败的须佐一派只能携带宝剑藏起来，而没有该剑镇压，八歧大蛇一怒打上高天原。众神都奈何不了他，便请了天照大神和月读神，二神用尽神力身陨，才将八歧大蛇封印住。
而八歧教因此慢慢扩大，不断打压天照教。没了天照教的庇护，主事的天皇逐渐失去皇权，而月读神一派的神女——巫女成为新的统治者女王。
九黎。由于九黎蚩尤氏族部落战败，倍受排挤的九黎便找上了阿修罗界的阿修罗王，在阿修罗王的庇护下，九黎才得以发展下去。由于阿修罗的搅局，才使十二祖巫相残，最后长眠于世。而佛祖为了苍生便与阿修罗展开战斗，最后以死圆寂，封印阿修罗王，至此落入尾声。
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