皇上关于暂停早朝的圣旨，在朝中没有引发多大的波澜，朝中需要做的事情太多了，诸多的官吏大都忙的脚不沾地，落实诸多的事情总是需要时间的，暂时不参加早朝也是好事情。
皇上的圣旨也说的很明确，因为朝中和地方需要落实的事情很多，且地方与朝中的诸多需要决断的事宜，可以交付内阁商议，最终由内阁进行禀报，不需要每日里的早朝来商议，今后就算是恢复早朝，也不需要每日都进行了。
离开南京之前，朱慈烺专门找到了左都御史路振飞和右都御史张慎言，叮嘱了近半个时辰的时间，说到的全部都是整顿朝纲的事宜，应该说整顿朝纲要从制度上面着手，上上下下进行全面的改革，这样才有作用，不过时间上面来不及，朱慈烺首先要稳定朝廷、稳定南方，首先要打败后金鞑子的进攻，所以当下只能从盯紧官吏方面着手。
路振飞为官耿直，仗义执言，不畏权贵，出任左都御史是最好的人选，不过这样的官员也有突出的问题，那就是眼睛里面容不得沙子，须知官场上是复杂的，千里做官只为财，朝廷给予官吏的俸禄少得可怜，养活家人都存在困难，如此情况之下，让官员清廉如水，那就是自欺欺人，朱慈烺必须让路振飞明白这一点。
至于说张慎言，朱慈烺最为欣赏的就是张慎言认定人之欲即天理，反对存天理去人欲，张慎言的这种思想，在品评官吏的时候，能够做到基本的公平公正。
朱慈烺专门提到了万历年间的内阁首辅张居正，说到了张居正的考成法，考成法注重对官吏的监督考核，以业绩为中心，行的升职，不行的贬职，且严格执行，此举大大提升了部门的办事效率，朝廷的决定得到了最为彻底的执行，今后朝廷亦要大力推进考成法。
朱慈烺的苦口婆心，甚至与路振飞、张慎言辩论，举了很多的例子，总算是让两人明白自己的苦心，那就是当下的南方，首要的是稳定，对于官吏的监督责罚，一定要从实际出发，切不可拔高要求，导致督查院对官吏的监督成为水中月镜中花。
朝廷官吏的配备，朱慈烺已经尽全力了，史书上面的南都三清，侯峒曾出任兵部左侍郎，陈洪谧出任户部左侍郎，徐石麟出任吏部左侍郎，至于说南明三贤相，高宏图与史可法已经是内阁大臣，姜曰广是翰林供奉、掌院学士，将来也是要进入内阁的。
至于说抗清三公，江阴的阎应元、陈明遇、冯厚郭，因为三人都只有生员的功名，短时间之内不可能启用，朱慈烺只能让龙祖山暗地里关注这三人，等到机会成熟之后启用。
江西总督袁继咸，赋闲在家的黄道周、翟式耜、黄端伯、朱大典等人，亦是朱慈烺特别关注的对象，特别是袁继咸、黄端伯何朱大典三人，袁继咸敢于直言犯上，为官清廉，黄端伯办事干练、广知博闻，朱大典能够带兵，有气节，这三人的能力都很突出，如果能够发挥其特长，对于朱慈烺将是巨大的帮助。
朱慈烺准备御驾亲征时候，黄端伯与朱大典两人已经奉旨来到了南京。
朱慈烺毫不犹豫的下旨，敕封黄端伯为礼部左侍郎，跟随前往山东，至于说朱大典，同样跟随朱慈烺前往山东，抵御后金鞑子的进攻，朱大典曾经长时间担任山东巡抚，对于山东的情况很熟悉。
跟随朱慈烺前往山东的，还有内阁大臣、兵部尚书史可法，锦衣卫指挥使卢元达，锦衣卫副指挥使龙祖山等人。
江西总督袁继咸，当下的主要职责是盯紧江西总兵刘良佐，防止刘良佐有任何的异动。
崇祯十七年，五月初八，辰时。
朱慈烺秘密从南京出发，乘坐漕船前往山东德州，其离开南京期间，朝廷的事情由内阁直接负责，内阁首辅唐王朱聿键总负责，南京一切照旧，除开内阁诸多大臣，六部的尚书，其余人都不知道皇上已经离开南京，前往山东了。
经过内部改装的漕船，从南京码头出发，前往山东。
两艘漕船全部由锦衣卫军士掌控，船老大不知道船舱里面是什么人，只是负责撑船。
大半天时间过去，漕船来到了淮安码头，淮安巡抚、漕运总督吴孟明来到了漕船上面，见到了皇上，吴孟明大惊失色，连忙行跪拜礼。
朱慈烺告诉吴孟明，漕运必须要保持畅通，漕粮一定要按时运送到山东德州，整顿之后的漕运兵丁，主要职责就是护卫漕运的安全，以往各个漕运码头存在的诸多帮派，若是能够听从官府的调度安排，服务于漕运，从中赚取钱财，不用理睬，若是打着帮派的名声，暗地里垄断地方漕运，甚至是抢劫漕粮货物，则要坚决予以剿灭，不管牵涉到谁，都不能够手软。
经过数月时间整顿，漕运的情形大为改善，工部将清理漕运河流作为主要的工程之一，已经投入一百多万两白银，漕运总督府则是重点整顿漕运秩序，斩断了很多伸向漕运的黑手，不过朱慈烺知道，冰冻三尺非一日之寒，漕运存在的诸多弊端，还要更进一步的清理，而这种全面的清理，与整顿吏治紧密相关，须知每个利益集团的背后，都是一大群的官吏。
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