爪哇岛的非金属矿产也极为丰富，仅在西爪哇省就有数以吨的石灰石矿、膨润土矿、沸石矿，如万隆地区就有近亿吨的石灰石矿，当地人将它与火山灰混合后烧制水泥；位于尖米士（Ciamis）的膨润土矿，储量约160万吨；位于塔西马拉亚（Tasikmalaya，也称打横）的膨润土矿，储量约798.7万吨；位于库宁岸（Kuningan）的膨润土矿，储量约104.3万吨；位于双木丹（Sumedang）的膨润土矿，储量1.06亿吨；位于展玉（Canjur）、茂物（Bogor）西的南宫（Nanggung）、苏加武眉（Sukabumi）地区的Jampang Tengah、Lengkong、Sagaranten、Gegerbitung、Cisolok、Surade、Bantargadung、Cikidang等地也有膨润土矿，每个膨润土矿的储量在数百万吨左右。在茂物西的南宫（Nanggung）有储量在1.25亿吨左右的沸石矿，在尖米士（Ciamis）地区也有储量在5千万吨左右的沸石矿；苏加武眉西的芝肯巴（Cikembar）有储量约1.6亿吨的沸石矿。泗水东部的马都拉岛有丰富的非金属矿产，主要是石灰石、白云石、石英石、方解石、磷矿、石膏矿。磷矿主要位于溶洞里，是数万年、数十万年的鸟粪经风化、发酵、沉积形成的磷酸盐矿，称为“洞穴磷矿”，如东爪哇省的锡达尤（Sidaju）地区及日惹的塞马努（Semanu）地区的很多溶洞里就有这种“洞穴磷矿”。
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