弗洛勒斯岛（Flores）有金矿、镍矿，金矿主要分布在岛西端的拉布汗巴焦（Labuan Bajo）。
龙布陵岛（Lomblendao）的鲍拉贾（Bauraja）地区有金多金属矿，该矿于1986年发现，黄金品位15克/吨，伴生银、铜、铅、锌。
阿洛岛（Alor）东中部的朗托卡（Lantoka）地区有金矿、铅锌矿、锡矿，还有高岭土矿。
帝汶岛（Timor）主要的矿产有金矿、锰矿、铬铁矿。帝力城西的科莫洛河（Comoro河）上游及其支流就有砂金矿。岩金矿主要分布在帝力城南30公里山区的毛比塞地区（Maobisse）、图里塞地区（Turiscai），铜金矿主要分布在岛东部的奥苏地区（Ossu）、格利卡地区（Quelicai）。铬铁矿主要分布在北拉克洛河（Rib Laclo河）上游的巴塔拉地区（Batara）。锰矿主要集中的岛的西部和北部沿海，仅古邦（Kupang）周围就有数亿吨可露天开采的锰矿，锰品位在65％左右，中国有多家公司在古邦周边投资了锰矿。北海岸马纳图托省（Manatuto）东20公里的弗马塞地区（Vemasse）也有近亿吨的锰矿，锰品位在56％左右。在西帝汶岛的腊尤山有磷矿，五氧化二磷品位在18％左右。岛上石灰岩分布广泛，如帝力东边的马纳图托省的石灰石矿中氧化钙品位在53％以上，属于高品质石灰石矿。在东帝汶的阿伊莱乌（Aileu）地区有高岭土矿、膨润土矿。
东帝汶所属的阿图鲁岛（Atauro，也称阿陶罗岛）有零星的小型金矿、铅锌矿。
（四）巴拉望岛
巴拉望岛曾一直是中国的岛屿，元代郭守敬在岛上建立过天文观测站，明代郑和下西洋的时候，曾在岛上设立过远洋基地。
巴拉望岛的矿产主要是镍矿、铬铁矿、汞矿。岛的南部有三大镍矿，分别是位于里奥图巴河（Rio Tuba河）中游的Rio Tuba镍矿、位于巴通巴通（Bato-Bato）海岸的Citinickel镍矿及位于西海岸奎松（Quezon）的Berong镍矿，仅里奥图巴镍矿的矿石量就达4亿多吨，镍品位1.5％以上，含铜、钴、金。岛南部的铬铁矿矿体长135公里，宽25公里，分布范围1500平方公里，三氧化二铬品位在42％左右，可以直接冶炼铬铁，也能用于耐火材料。
巴拉望岛的汞矿位于岛东南部的索夫罗尼奥（Sofronio）山谷，汞储量在3000吨以上，今菲律宾停止开采巴拉望岛的汞矿后，在那里留下了一个长2.5公里、宽550米的矿坑）。
巴拉望岛有很多石灰岩质、石英石质山脉，因此石灰石矿、石英石矿资源十分丰富。
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