故事的起因是黄石宗的一个杂役，杂役的修炼天赋肯定没多好。按正常的修炼是筑基无望了，可谁知这个杂役却是另辟蹊径，用灵气淬炼肉体，竟然还成功了。这要是他一个人也没啥，可他却拉拢了宗门筑基无望的杂役弟子们，传授他们自己摸索出来的修炼之法。一年年地暗地发展，竟然给他聚起了不小的势力，宗门发现时，为时已晚，已经尾大不掉了。
对于他这种另辟蹊径的修炼，宗门是不能忍受的，这不是异端邪说吗？宗门要坚决镇压，而被镇压的要想生存那就只有反抗。于是杨家界也是三仙界爆发了有史以来宗门内最大的内讧。这场仗打得旷日持久，以至于一个山清水秀，灵气氤氲的黄石山被双方打得千疮百孔，灵脉尽毁，双方高手伤亡殆尽。双方剩下的低端弟子一看再争下去已无意义，就算得了这座黄石山又有何用？灵脉已毁，成了普通的山峰一座，已无开山立宗之根本了。于是双方弟子一哄而散，自寻门路去了。
孙家当年的先祖乃是宗主的童子，宗主临终时也不知出于什么原因把掌门信物黄龙令传给了孙家先祖，并收为弟子。最大的可能是当时只有服侍他的童子，而其余人又不在眼前。让他没得选择也就不选择了，让孙家先祖以后重振黄石宗，再现黄龙真人时期的辉煌，带着不甘和懊悔仙去了。
孙氐先祖就这么从一个童子一跃成为了黄石宗掌门，并肩负着振兴黄石宗的重任。可放眼看去，偌大的黄石宗就只剩他孤身一人，只要随便来一个修士，一指头就能让黄石宗全灭。孙氏先祖也是头脑灵活，复兴暂且无望，那就蛰伏。在埋葬了宗主之后，就在半山腰隐居修炼，对外则称是黄石寨而非黄石宗，让人一听就是常人居所，从而放下戒心。孙氏先祖就这么隐居勤苦修炼，以待功成复兴黄石宗。
可修炼不是你想修多高就能修多高的，没有天赋，再勤奋也是枉然。一个人的修炼，又没有资源辅佐，天赋又不是很好。孙氏先祖的修炼可想而知，在修炼到炼气八层后，他自知无望筑基，于是下山娶了一位妻子回来。说是娶，其实就是换，一百斤谷子，换了一位农家女。
农家女给他生有二子，所幸二子皆有灵根，虽然不佳，但是有。有了灵根就代表有了希望，在孙氏先祖临终时，传位于修为高的二子，并叮嘱这个重任要一代代的传下去，要不然黄石宗在他孙氏手中断绝了，那他死不瞑目。
于是就这么一代代的传下来，儿生孙，孙再生子，有灵根的留在黄石寨修炼，无灵根的送去俗世生活。传到孙传文的手上，黄石寨已是有一百多户有灵根的家族了，
孙成安听了暗自咋舌，厉害了我的爹，你竟然还有这么一个牛逼的身份，不但是孙氏家族家主，黄石寨寨主，还是曾经名震三仙界的黄石宗的宗主。虽然这个宗主有些名不符实。
“爹”孙成安问道:“三界中那些号称体若金刚，万物不伤的体修是不是就是当年那杂役弟子的传人？”
孙传文点头道:“是的，就是当年逃走的余蘖的传人。你记着，他们和我们乃是不共戴天的仇人，见一个要杀一个，可不能心慈手软。”
吃过午饭，孙传祥和孙传文来议事，孙成安被胡英娘拉去好好疼爱了一番，回到自己的房间孙成安越想越不对劲，好好的一个宗门就这么被内讧打没了，难道就没有别的解决办法了吗？他不由自主地就想起了陈烨，虽然相处时间不长，但孙成安心里已把陈烨当成了可信任之人，尤其是陈烨口中不时蹦出的新奇词语，让自己有耳目一新之感，这事问问陈烨，或许能给自己一个不一样的解答。
喜欢五灵根修仙传请大家收藏：(m.shuhaige.net)五灵根修仙传书海阁小说网更新速度全网最快。