时空追猎者在时间滤网的帮助下，锁定了一处混沌碎片的藏匿点——某个被遗忘的平行宇宙。时幻和溯影带领小队穿越时，发现这个宇宙的时间流速是现实的千倍，所有文明都已在混沌中毁灭，天空中漂浮着巨大的暗紫色茧状物，茧内隐约可见混沌子嗣的轮廓。当他们试图摧毁茧时，茧突然破裂，释放出无数携带混沌记忆的飞虫，这些飞虫钻入追猎者的意识，让他们看到了混沌眼中的宇宙——一个只有毁灭与重生循环的"完美世界"。
信仰者们的信念根系腐斑面积急剧扩大。明心带领信徒们深入腐斑核心，发现那里存在着"绝望祭坛"。祭坛上插着的旗帜，竟由各个文明守护者的绝望情绪编织而成。当信徒们试图摧毁祭坛时，祭坛释放出"记忆枷锁"，让他们不断重温最痛苦的失败经历。一位曾亲眼目睹家园毁灭的信徒，在枷锁中崩溃，他的信念之力瞬间转化为暗紫色的绝望洪流，险些冲垮整个信念根系。
星痕在分析各方情报后，意识到混沌余孽正在策划一场更大的阴谋——它们企图集齐元素逆核，唤醒宇宙深处的原初混沌。而此时，天穹议会内部也出现了分裂。部分机械文明的代表主张用更强大的武力 preempt 打击，魔法文明的占卜师则认为应寻找古老的封印仪式，修真文明的长老坚持闭关修炼以提升实力。星痕站在议会大厅中央，望着穹顶上映射的各个文明星图，深知如果不能再次团结，多元宇宙将真正迎来末日。
在一次紧急会议上，星痕展示了从时空追猎者那里获取的混沌计划全息投影。画面中，混沌余孽们围绕着巨大的元素逆核阵列，它们的身体在暗紫色能量中若隐若现，口中念念有词。突然，画面切换到一个陌生的星域，那里漂浮着一颗巨大的暗紫色星球，星球表面布满类似神经网络的纹路，散发着令人心悸的压迫感。星痕的声音在寂静的大厅中回荡："这不是普通的星球，而是混沌为原初混沌打造的容器。一旦完成，整个宇宙都将被吞噬。"
机械文明迅速启动"曙光工程"，夜刃带领团队在三个月内完成了"秩序巨像"的设计。这尊由量子合金与希望结晶打造的巨像，高千米，双眼是两个微型黑洞，手臂能发射秩序湮灭炮。但在测试阶段，巨像突然失控，它的双眼喷射出暗紫色的光束，将测试场化为废墟。工程师们在残骸中发现，混沌代码已渗透进设计图纸的底层算法，甚至修改了安全协议。
魔法文明的元素使们在元素精灵王的带领下，前往传说中的"元素起源之地"寻找对抗元素逆核的方法。在那里，他们发现了一座古老的元素祭坛，祭坛上刻着创世时期的元素战争历史。当元素精灵王用本源之力激活祭坛时，一道纯净的元素洪流喷涌而出，其中蕴含着能够净化元素逆核的"元素圣血"。但祭坛周围突然出现混沌守卫，这些守卫由扭曲的元素生物组成，它们的攻击能将元素圣血污染成暗紫色的毒水。
修真文明的长老们在万仙山深处找到了失传已久的"鸿蒙混沌诀"。此功法可在混沌之力中汲取力量，再将其转化为净化之力。但修炼此诀需经历"三灾九劫"，稍有不慎便会被混沌吞噬。太虚子的残魂化作引路人，带领百位修士开始修炼。在经历雷劫时，天空中落下的不再是金色雷霆，而是暗紫色的混沌雷，这些雷不仅能摧毁肉体，还能腐蚀道心。
时空追猎者们在时间夹缝中发现了"时间守望者"的遗迹。这些守望者是创世时期负责维护时间稳定的神秘存在，他们的遗留设备中保存着对抗混沌的时间武器设计图。时幻和溯影带领团队开始仿制这些武器，但在制造过程中，时间线多次出现分支，每个分支都衍生出一个被混沌统治的末日世界。他们必须在不同的时间线中穿梭，收集制造武器所需的特殊材料，同时还要防止这些分支时间线与现实融合。
信仰者们在明心的带领下，发起了"希望火种"行动。他们将信念根系延伸到宇宙的每一个角落，点燃每一个生命心中的希望。在一个被混沌阴影笼罩的星球上，信徒们遇到了被奴役的原住民。这些原住民的身体被植入了混沌芯片，失去了自主意识。明心用创世圣杖的光芒净化芯片，当第一束金色光芒照在原住民身上时，他的眼中闪过一丝清明，随后发出了压抑已久的怒吼，这怒吼声成为了反抗的号角，越来越多的原住民开始挣脱混沌的束缚。
星痕带领破晓先锋再次出击，目标是夺回一枚关键的元素逆核。他们追踪到逆核位于一个名为"熵寂深渊"的星系。这个星系被暗紫色的雾霭笼罩，所有的物理法则在这里都失去了作用。特遣队的飞船刚进入星系，就被一股无形的力量拉向深渊底部。在深渊中，他们遭遇了混沌余孽的终极武器——"熵寂漩涡"。这个漩涡能将一切物质和能量分解成最原始的混沌状态。光牙挥舞生命破晓，试图用生命能量稳定周围的空间；焰心将双生火焰融合成净化之火，焚烧漩涡边缘的混沌物质；云渺不断折叠空间，试图找到漩涡的弱点。
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