主角刘司凡，年龄28，爱好游戏漫画。
手机铃声响起。
“重生的力量来自真我.....”
车祸现场，刘司凡知道自己不行了。他艰难的望向不远处的手机，不知道谁打来的，要是真的有重生就好了。他慢慢闭上眼睛，但却看到到了一束无比明亮的“光”。
现实世界，车祸现场的人们被光闪了一下，然后发现车祸的主角不见了。
未知之地，载着主角的“光”来到了一片虚无之地，虚无之地漂浮着无数光球。光射入其中一个光球，刘司凡感觉像是回归母体一般，但只是一瞬间彷佛是折射一般，光束偏了个方向又射了出去...。
如果空间是无限的，而且物质分布在大尺寸上是足够均匀的，那么即使最不可能发生的事情也必然发生在某处。
存在无限多有人的行星，而且包括不是一个而是无限多和你一样的外表、姓名、记忆的人。无限多个可观测宇宙大小一样的区域确实存在，在那里任何可能的宇宙历史都会实际存在。
这就是平行宇宙存在的理论猜想之一。
那束承载着刘司凡一切信息的光来到了一个新世界，还原成刘司凡，不过肉体状态似乎回到了小时候。
不久之后刘司凡这个找不到父母的6岁小孩就被警察送往当地的孤儿院，这是1990年的巨峡市。当刘司凡知道这是巨峡市之后多方探察对比，最终确定了这就是那个群魔乱舞的超神学院世界。
来到这样的世界作为普通人刘司凡压力山大。花了一周时间梳理记忆，并做了人生规划。
第一：科学知识在这个世界非常重要，而搞科研不能没有钱。
第二：作为一个普通人必须拥有一套超级基因才能在这群魔乱舞的世界好好生存。
第三：获取这个世界最重要知识，包括虫洞搬运技术、暗位面技术、各种基因引擎技术、天体计算机技术。
首先第一步成为一个正常的基因工程研究员，而这需要学习。
凭借前世的基础，刘司凡很快通过跳级等手段于15岁考上大学，16岁考上研究生，20岁时已经是基因工程业内大佬。
同时也自学电脑硬件相关知识，加上前世的IT软件相关知识基本满足超神基因研究的前期知识储备，缺的是一套超神基因的原始模板。
经济方面互联网，物流等几个风口的投资让他很容易赚到了钱。然后为了基因工程成果应用，创办了一家生物制药公司-保护伞公司，当然过程中不可避免的也接受过天使投资。
这一年是2004年离剧情开始还有10年。刘司凡按照计划开始寻找基因模板。唯一不在当局监控中的超级战士就是琪琳，所以这些年一直留意她的踪迹。
2004年她还在上高中，一次运动比赛琪琳受伤，刘司凡通过手段搞到了她的基因样本。
姓名：琪琳
基因型号:神河狙击手
技术等级：神河一代超级基因
拥有强大的即时反应和预判能力，能使用弑神一号穿甲弹。
2005年刘司凡联合暗物质暗能量专家以研究多年的技术为基础再加上琪琳超级基因样本做参考，自研完成了暗物质计算机架构。同年完成基于自研暗物质计算机硬件的底层定义机器语言、汇编语言及高级语言“符文之语”。
暗物质计算机的研究，揭示了超神世界暗位面的部分秘密。
根据研究显示（部分来自百科其他的作者瞎编）：宇宙诞生的时候，产生了正能量和负能量，两者相等。
正能量产生了正反粒子。正反粒子的数量原本应该一样，但是实际上可能一百亿对粒子之外会多一个正粒子，于是经过正反粒子的湮灭，产生了大量的热量并剩下了大量的正粒子。剩余的热量就是宇宙背景辐射，而剩余的正粒子就形成了我们看到的物质世界。
负能量可以理解为引力场的能量。现在的科学家认为万有引力是负能量的主要组成部分。正常宇宙有关引力作用的事件都是暗物质主导。而宇宙中占主导的暗能量引起斥力，所以推测负能量形成了暗物质和暗能量。
正能量形成了正常物质与宇宙微波背景辐射的正时空（三维空间+时间）。
负能量形成了暗物质与暗能量的负时空或着叫暗位面。
正能量和负能量相遇只会归于虚无。
现在的超神宇宙暗位面是经过了神河文明等等高等文明秩序化后的，易于被高等文明使用的状态，原本的暗位面应该是混沌的。
2007年刘司凡完成暗物质计算机的实验建造。
2008年历时4年的暗物质计算机植入基因技术突破，第一代超级基因（硬件）完成。同年完成超级基因的操作系统刘司凡将其命名为“智慧-1”，区别于神河基因操作系统。
2009年刘司凡在智慧系统上安装暗能量驱动引擎（转录自琪琳的超级基因引擎）。
引擎可以简单理解为电脑里的驱动软件。比如只有安装了驱动，打印机才能被电脑识别控制。安装了暗能量驱动引擎，超级基因就可以驱动暗能量。安装了虚空引擎，超级基因就可以驱动虚空的力量改写规则。安装了太阳之光驱动引擎，超级基因就可以驱动所有的恒星能源。
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