进入1885年后，虽然在镇南关战役中取得了显着胜利，甚至成功收复了谅山等地，但清政府却选择了趁胜求和的战略方向，下令停止一切军事行动并与法国进行和平谈判。对于这种做法，作为坚定主战派代表人物之一的左宗棠感到非常不满，他认为应该继续施加压力迫使对方接受更加有利的条件。为此，他曾向朝廷提交了一份题为《密陈要盟宜慎防兵难撤折》的奏疏，力图说服决策者改变既定方针，可惜未能如愿。
更令左宗棠气愤的是，潘鼎新、刘铭传等人借机陷害攻击“恪靖定边军”首领王德榜及其支持者台湾道刘璈，导致二人失去权力。面对如此局面，左宗棠不得不站出来为自己的部下辩护，并表达了强烈的不满情绪。最终，在屡次建议未被采纳的情况下，这位老将选择了称病辞职的方式表达抗议，结束了自己长达数十年的政治生涯。
九、抱憾而终
1885年，左宗棠虽已年逾古稀，但依然心系国家安危。那一年的7月29日，在意识到自己健康状况日益恶化的情况下，他向朝廷提交了两份重要的奏折。第一份奏折中，左宗棠建议设立专门负责海防事务的大臣职位，以加强沿海地区的防御能力；第二份则提议将福建巡抚的职责范围调整为专注于台湾岛的治理，即成立一个独立的台湾省。这些建议反映了他对当时中国面临外来威胁时所表现出的战略眼光与前瞻性思考。
不久之后，清政府采纳了他的部分建议，成立了总理海军事务衙门，并最终决定将台湾正式设为一省，这标志着左宗棠生前最后的努力得到了认可。然而，就在这些重要决策出台之际，左宗棠却因病重无法亲眼见证其实现。
同年9月5日，左宗棠在福州逝世，享年七十四岁。临终前，他口述了一份遗折给皇帝，这份遗言充满了对国家未来的深切忧虑以及对未竟事业的遗憾。左宗棠首先表达了对清朝统治者的感激之情，感谢多年来给予的信任和支持。接着，他提到了中法战争期间未能充分展示国力、彻底击败敌人的不甘心，认为这场冲突是检验中国实力的关键时刻。尽管如此，左宗棠并没有沉浸在个人的情绪之中，而是提出了多项关于如何增强国力的具体建议，包括加强军事建设、发展教育体系等措施，并鼓励年轻的光绪帝继续努力振兴国家。
消息传到北京后，清廷上下深感悲痛。为了表彰这位杰出的政治家和军事领袖一生为国为民作出的巨大贡献，9月27日，清政府追赠左宗棠为太傅，并赐予“文襄”这一尊贵的谥号。“文襄”意指其既有卓越的文学才华又具备优秀的辅佐之能，是对左宗棠全面才能的高度肯定。此外，还特别允许将其牌位供奉在京师的昭忠祠（纪念忠勇将士）和贤良祠（纪念德才兼备之人），并在湖南及其立功省份建立专祠以示纪念。
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