于是自那时起，E星所有国家、人类暂时抛下一切成见，所有人类迁徙，物资转移，开始建造人类有史以来最大，最雄伟的奇观。
这一工程耗时15年，自柯伯格教授33岁开始，直到他48岁末才初步完工，期间，不算上后勤保障人员，仅参与工程人数也达到30亿，
而自那一年开始，E星稳定的气候系统也终于告竭，所有还存活的人类进入了地下城中生活。
只是没过多久，新的问题再度出现，
由于基地人数太多，人与人之间无法保持距离，于是摩擦渐起，
起初因为基地的规则严苛，大家也都只是动动口角，还不敢动手，
但渐渐地，达到了忍耐的限度后就有人开始不管不顾地大打出手。
为了保障基地内部社会结构稳定，柯伯格教授提议将人们按照心灵净化值进行区分，
上层基地，用来给心灵净化值400以下的人类生活，进行更合适的教育和管控，
中、下层，则是生活着心灵净化值400以上的人类，期望让高心灵净化值的人潜移默化影响低净化值的人。
为了让人们更容易接受，他直接将自己当初的遭遇广而告之，印成儿童读物，发放给了地下城生活着的人类，
并将心灵净化值的真实内涵告知了所有人，希望E星人类能在这一次灾难当中集体升维。
得知了宇宙真相的人类确实也很快就接受了这个设定，而且这个计划在当时几乎没有阻碍就得到了大部分人类的认同，得以顺利展开。
但世事总有意外，
这种划分行为也总会有人不满，
虽然升维一事对于大部分人而言是一场积极向上的自我救赎行动，
可对于部分净化值极低的人来说，他们自认为差距太大升维无望，便准备摆烂，
甚至，不知在谁的怂恿下，竟在基地内逐渐兴起了一场隐秘的针对于中下层人类的毁灭计划。
发生的时点也正是选在了基地内部矛盾最大的那场饥荒事件当中。
视频里的饥荒事件与已经尸首分离的约翰讲的大差不差，
为了克服那场饥荒，柯伯格首次将自己人工智能——莉莎摆上台面，
在经过重重审核之后，他成功接入了地下城最大的也是唯一的一台量子计算机，并真的在一个不长的周期内就研发出安全无害的药剂，解决了那时的饥荒问题。
然而令人意想不到的事情再度出现，药剂成了危害人类的突破口。
在上层基地的某个不知名组织的运作中，他们潜入了当时药剂生产基地，将不知从何处获取的某一种慢性毒物添加进药剂当中，
之后，他们还假扮成生产部门的人，伪造药剂检验合格证明，令所有注射了药剂的人类深受其害。
原本那些人以为这一毒物的作用只是让人慢性死亡，
却不想，所有注射了药剂的人类，全部变得失去了人性，成了真正的野兽，导致其他没有注射药剂的人同样受到了波及。
基地调查署的人很快介入调查，然而当他们查到是药剂问题的时候已经太晚了，
为了挽救，考虑到当时大部分政界人士已经变异，于是柯伯格教授没有阻碍的直接让AI莉莎彻底接管地下城的全部网络，打算在引导畸变体进入中层区域封锁他们的同时着手研发反制药剂。
为了以绝后患，柯伯格教授准备先清算一切有关人员，
只是令他更为意想不到的，基地内关于上层的监控内存全部被人为损毁，导致只能根据蛛丝马迹找到极小部分的人，
可人性和现实终究还是没能让他做到宁可杀错，不可放过，加上当时时间紧张，教授也只能准备来日方长，秋后再议。
然而，在之后研发反制药剂的过程当中，柯伯格教授越是深入研究，越是心惊，
因为他发现，被添加进药剂当中的物体并不是E星上存在的任何物质，大概率是来自外星的产物，
这也就意味着他根本没有办法做出解药，可这种东西又是谁带来了？
难不成人类基地被某个邪恶的外星种族渗透？
于是他准备利用心灵感应寻求宇宙友好者联盟的帮助，
也就是这个时候，更糟糕的事情发生了，
他发现不知从何时开始，原先在天空接引人类灵魂的隐形飞船消失了，转而变成一个肉眼不可观测的灵魂黑洞，
这个黑洞会将所有进入其中的灵魂撕裂，搅碎，也就导致人类将不再存在所谓的轮回转世，死既是真正的死亡，不会再重生。
面对这一恐怖的发现，为了保证人类的延续，他只能循着小时候与外星人邂逅的记忆，研发出一款能够将所有被辐射到的人的灵魂禁锢住的仪器，保证人类死亡之后灵魂不会升天而被天上的灵魂黑洞撕裂，导致真正的湮灭。
好在他在这一点上成功了。
只是没过多久，在上一次清算的绞杀行动中残存的余孽再度卷土重来，更糟糕的是，他们这次直接占领了基地上层，控制了上层的一切，准备和下层分庭抗礼。
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