维修空洞虽然并不复杂但是却耗时耗力，数千年来神树的墙壁从来没有被打破过，不过所幸，玄女知道神树的仓库里蕴藏着不少维修用的材料，这点确实让众人惊讶。很多机关闸门，对玄女几乎完全开放，很多地方甚至马尔杜克也是第一次去过。
神树之中有许多的奥秘，马尔杜克本人也只是略知一二，他只是在神树中建造神域，但是对神树内部本身并不是很了解，反倒是玄女，现在的她好像才是神树的主人。
玄女带着他们找到了维修用的材料，将空洞迅速填补起来。但是玄女也把众人带到了连马尔杜克都不清楚的区域。而正是在这些神秘区域的废弃仓房里，玄女很明白莉莉丝藏起来的后羿就在这些地方。趁着找后羿的这段时间，他们打算好好的探索一番神树。
马尔杜克建造的神域，位于神树的树冠处，高约六百里，而在占神树主体的树干处，马尔杜克知道的只是大空洞和深渊，而玄女则是带他们进入了神树的树干处。这时候他们才明白神树只是一个称号，整个神树是一个异世界文明所建造的。以往马尔杜克探索之时，使用的办法无非就是使用神力将金属闸门摧毁，但是金属闸门太多，马尔杜克事务繁忙，哪有功夫一个个打开看。但是玄女却很轻易的发出某种指令，将闸门打开，通过升降梯顺利的来到任何一层。
在神树之中空间犹如蜂巢一般，内部复杂，而且看起来还是等级森严的社会模式，就如同蜂群一般，居住在这里的人拥有复杂的社会结构，统治阶层、管理者、生产者的区别一目了然，不同的空间里还有专门种植粮食的土壤，还有饲养场，但是因为时间过长，土壤早已失去养分沙化，饲养场也都是牲畜们的残骸。
玄女看着那些早已失去的能量的机器人，说道：“曾经入侵我们世界的文明，他们就聚集在神树中生活，很明显他们的生产力水平非常先进，生活水平也比我们高的多。”
启说道：“能建造如此巨大的聚集地，看样子他们也在这里生活了非常长的时间。”
玄女说道：“没错，生活在这里的人们，过着非常安逸的生活，依靠科技和丰富的资源，失去了奋斗的动力，以至于拥有如此强大的科技和力量，最后反而少数强大的神率领着一群极为落后的人赶回他们原本生活的世界。”
启问道：“如果把我们的人都搬到这里，那一定会生活的非常幸福吧。”
玄女说道：“任何事情都需要代价，现在哪里来那么多供养那么多人的资源和能量，况且现在我们的文明实在太落后，根本无法短时间掌握那么多的技术。”
探索了一段时间后，他们来到了一个让人感到密集恐惧症的地方，四周都是密密麻麻排列着半透明的卵状容器，绝大多数已经破裂，启刺破了一个卵囊，里面流出大量的粘稠的液体，还有一个死亡的胚胎。
马尔杜克说道：“这应该就是父神曾经说的被称之为母巢的地方。”
“母巢？”众人问道。
“听说入侵我们的异世界人，不是靠自然分娩，而是靠这样的特殊装置，制造出来，这是他们延续族群的手段。”
启此时感到头皮发麻：“这简直闻所未闻。”
此时众人听到了一些动静，众人循着声音走了过去，看到一个卵囊中有人正在挣扎，启撕破卵囊，原来后羿就被藏在里面，众人即可将他带回了神域。
晚些时候，启接到了来自马尔杜克和玄女的委托，启自然是要照办的，启去见马尔杜克，玄女就在一旁，马尔杜克问道：“启，你觉得这些神树的圆环区，为什么莉莉丝能够进入？”
启说道：“这些地方，连神王进去都很麻烦，而她进出却没有很费劲，看样子她在一定程度上拥有类似于玄女的权限。”
“我们希望得到更多的权限和信息，所以我希望你去一次乌鲁克。”
“为什么？哪里有什么吗？”
玄女说道：“我们要你去吉尔伽美什王陵，从他的陵墓中找到一个名为【天命石板】的神器。”
“【天命石板】？”
马尔杜克说道：“这是我的父神埃阿，赐予历任苏美尔之王的神器。这件神器千年来护佑苏美尔人，苏美人通过【天命石板】赐予的神谕，创造了辉煌灿烂的文化，后来吉尔伽美什去世，【石板】亦跟随他进入陵墓。”
启问道：“看样子是很厉害的东西，有什么作用呢。”
“解锁更高一级权限的钥匙。”玄女说道。
“权限？钥匙？”
玄女说道：“很难理解吗？职位越高的将领，就能指挥越多的士兵。”
“这么个意思？”
玄女说道：“有了天命石板，我可以同时驾驭所有的巨型机器人，而不是进入一台机器成为驾驶员。”
启说道：“我明白了，这就出发。”
得到命令的之后，启便动身出发，这一次，战神提尔和他一同前往乌鲁克，毕竟提尔也想见一见这位人类最古老王国的国王到底是什么样的人。
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