到达后，艾丽发现现场情况极其复杂，磁场消失的原因并非单一因素所致。在探测过程中，舰队不断遭受不明电磁脉冲的袭击。艾丽推测是一股隐藏在暗处的势力蓄意为之，目的是掠夺这些星球上丰富的稀有资源。
艾丽指挥舰队释放特殊的磁场稳定器，暂时稳住几颗濒临崩溃的星球。接着，她带领一队精英队员顺着电磁脉冲的来源追寻而去。最后，他们发现一个巨大的地下基地，里面布满了复杂的仪器设备。
艾丽等人小心翼翼地潜入，就在快要找到主控制台时，触发了警报。无数机械守卫蜂拥而至。艾丽和队员们奋勇抵抗，成功摧毁大部分守卫。
艾丽及时赶到主控制台，凭借自己的技术知识，逆转了磁场消失的进程。星球磁场逐步恢复，艾丽再次挫败了破坏宇宙和平的阴谋，踏上归程准备接受下一个挑战。
艾丽刚回到联盟总部，还没来得及喝口水，警报声再度响起。监控显示，在室女座方向有一个神秘虫洞突然扩张，从中涌出大量未知的机械生物，这些生物正朝着附近的宜居星球飞去。艾丽顾不上疲劳，迅速召集舰队朝着室女座进发。
到达目的地后，他们发现这些机械生物结构复杂，外壳坚硬无比，常规武器难以击破。艾丽命令舰队启用新研发的量子束武器，这才稍稍抵挡了机械生物的攻势。但这些生物似乎有着自我修复功能，受损后很快又能投入战斗。
艾丽在战斗间隙观察到这些机械生物背后都有一个相同的核心部件在闪烁。她灵机一动，组织了一支突击小队，专门针对这些核心部件进行攻击。在精准的打击下，机械生物纷纷瘫痪。
然而，虫洞并未停止扩张，反而有更多的威胁隐隐浮现。艾丽深知，这又是一次严峻的考验，但她毫不畏惧，准备深入虫洞探寻根源，彻底解决这个危机。
艾丽挑选了几名最得力的队员，一同乘坐强化后的穿梭机冲进虫洞。虫洞内空间错乱，时间流速也不稳定。他们遭遇了一波又一波机械生物的攻击，好在队员们配合默契，一次次化险为夷。
终于，他们来到虫洞深处，发现一台巨大的母机正在源源不断地产出机械生物。艾丽迅速分析母机结构，找到了其能量供应枢纽。
就在他们准备动手破坏时，周围空间突然凝固，一个神秘的光影浮现。光影警告艾丽不要干涉，否则将引发宇宙更大的灾难。艾丽据理力争，认为任由这些机械生物肆虐才会真正破坏宇宙和平。
双方僵持不下之时，艾丽注意到光影的波动与母机能量枢纽相连。她果断发动攻击打破空间禁锢，同时队员集火能量枢纽。光影消散，母机崩坏，虫洞开始收缩。
艾丽和队员顺利逃出虫洞，看着虫洞消失，艾丽松了口气。她知道，以后还有无数挑战，但她坚信自己和联盟始终能守护宇宙和平。
艾丽刚回到总部，就接到一个意想不到的通讯请求。屏幕上出现的竟是一个之前被她打败的反派头目，不过看起来十分虚弱。他声称知道一个关于宇宙终极毁灭的大阴谋，希望通过提供线索来换取赦免。艾丽半信半疑，但还是听他讲述。
原来有一个潜藏在多元宇宙缝隙中的黑暗组织一直在暗中策划，他们意图收集各个宇宙的核心能量，目前已经在多个宇宙得手，一旦集齐将重启所有宇宙规则，届时万物皆灭。艾丽意识到事情的严重性，决定组建一支跨越宇宙的特别行动队。
她挑选了各个星球最优秀的战士，包括精通空间跳跃的泽尔族人和擅长精神力对抗的莫拉族人。他们穿越一个个宇宙裂缝，追踪黑暗组织的踪迹。在一个废弃的宇宙角落里，终于发现了黑暗组织的基地。
艾丽制定了精密的进攻计划，兵分几路突入基地。在战斗中，艾丽直面组织首领，发现他居然能操控时间。艾丽拼尽全力与其周旋，关键时刻，队员们合力打破能量护盾，艾丽趁机给予致命一击。成功阻止了阴谋后，艾丽带着队员们返回联盟总部，继续守望宇宙和平。
艾丽在总部还未停歇几日，监测系统又捕捉到异常信号。这次是在一个新生星系，那里的恒星光芒忽明忽暗，极不正常。艾丽率领舰队迅速前往。到达后发现，有一种无形的力量在吸食恒星能量。艾丽判断这可能是一种新型的宇宙寄生虫。它们身形透明且能隐匿自身能量波动，极难对付。
艾丽下令释放特殊扫描波，试图找出寄生虫的实体。经过艰苦搜寻，终于定位。艾丽指挥舰队用高能射线网将寄生虫围堵起来，可寄生虫竟开始融合，形成一个巨型虫体，冲破了防线。艾丽当机立断，亲自驾驶装载了新发明的引力牵引器的战舰冲向虫体，利用引力牵制住它，并引导队员从侧面攻击其能量聚集点。
经过一番激战，虫体能量渐渐衰竭。艾丽看准时机，发出最后一击，成功消灭寄生虫。看着恢复正常的恒星，艾丽露出欣慰笑容。她知道，宇宙维和之旅永不停歇，但她和联盟永远是宇宙和平的坚实守护者。
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