然而，天不遂人愿，或许是命运的捉弄，亦或是敌人太过狡猾。就在他们紧锣密鼓地策划暴动之际，因一时疏忽，行动计划不幸泄露出去。这一意外变故犹如晴天霹雳，令整个局面瞬间陷入危机之中。官府闻讯后，立即展开大规模搜捕行动，对孔广汉、徐永焕等首要分子下达通缉令。面对来势汹汹的官兵围剿，孔广汉和徐永焕等人无奈之下只得被迫逃离家园，远走关东，以期能躲避这场灾难。至此，原本轰轰烈烈的农民暴动最终还是难逃夭折的厄运。
话说回来，其实当时选择的那座山地理位置极佳，周围山峦起伏，峰岭相连。山上植被繁茂，绿树成荫，为义军提供了天然的屏障和掩护。而且，山间道路崎岖复杂，有利于义军与清兵周旋作战。只可惜，这支义军成员大多来自街头一带，乡土情结深厚，对于远离家乡一事始终心存顾虑，难以割舍那份对故土的眷恋之情。最终，走投无路的厉应九不得不带领着两千多名满怀义愤的义军登上了高耸入云的驼儿山顶，并在此处安下营帐、扎起寨子。他们马不停蹄地开始修筑坚固的防御工事，辛勤地囤积粮草，日夜不停地加强军事操练，一场轰轰烈烈的起义就此拉开序幕。这支义军被命名为“驼儿山义军”，而其秉持的宗旨则是“坚决消灭那些作恶多端的洋鬼子，让同胞们不再遭受洋人的欺凌与压迫！”
在那个时候，饱受洋教徒欺压之苦的百姓们早已心怀不满，如今看到有人带头起义，大家更是万众一心，众志成城。而厉应九因其崇高的威望以及果断勇敢的行事作风，成为众人心中当之无愧的领袖。他一声令下，众人便毫不犹豫地响应执行。平日里，义军成员各自在家中耕种田地以维持生计，但每隔五日都会聚集起来接受严格的军事训练。一旦遇到紧急情况需要集合，只需敲响位于驼儿山前那座宏伟庙宇中的一口大钟即可。这口大钟声音洪亮，能够传播至方圆十几里之外，因此召集人员变得极为便捷高效。
与此同时，驼儿山义军还获得了广大人民群众的全力支持。由于资金有限，无法统一购置精良的武器装备，于是每个人都自行准备趁手的兵器；每次集合的时候，也都是各自携带干粮饭菜。此外，周边一些思想开明的乡绅们，或是公开表示支持，或是暗中提供钱财和粮食等物资援助。而厉应九在商界和武术界所结识的众多好友，有的毅然决然地前来投靠加入义军队伍，有的慷慨解囊出资相助，在这些力量的汇聚之下，驼儿山义军得以迅速发展壮大。
话说那“驼儿山义军”占据山头安营扎寨，消息传到山东巡抚周馥耳中，他不禁大惊失色。这还了得！竟有人敢公然造反？周馥心急如焚，当即便火速下令让沂州知府胡建枢率领三千精兵强将，兵分两路气势汹汹地前去攻打。
胡建枢领命之后不敢有丝毫怠慢，很快就指挥着大军将驼儿山围了个水泄不通，犹如铁桶一般。紧接着，他们又派出当地德高望重的士绅和年高德劭的老人上山去劝说义军投降。这些人带着周馥的劝谕书以及“释械归农、一概免究”的告示，满怀希望地上山而去。
然而，面对官兵们的威逼利诱，义军首领厉应九却丝毫不为所动。只见他一脸坚毅之色，义正言辞地断然拒绝道：“我们既然举旗起义，就绝不会轻易向你们这群贪官污吏低头！想要我们投降，简直就是痴人说梦！”其态度之坚决，令人为之动容。
见劝降无望，官兵们终于按捺不住性子，决定强行攻山。时间来到清光绪二十九年五月初六这天，随着一声令下，官兵们如潮水般涌向驼儿山。而此时的起义军虽然人数远远少于官兵，但他们并未因此胆怯退缩。相反，凭借对山中地形的熟悉，义军巧妙地利用山上的雷木滚石等天然防御工事，一次又一次成功地击退了官兵的猛烈进攻。
这场激烈的战斗场景，在山东巡抚周馥呈递给朝廷的奏折中有详细的描述。据奏折所述，当时厉应九亲自坐镇山寨，指挥义军奋勇抵抗。他们不仅枪炮齐发，火力凶猛，而且还不断朝山下乱扔石块，打得官兵们狼狈不堪。短短片刻之间，已有十余名官兵受伤倒地，损失惨重。
经过了一段漫长而激烈的战斗之后，义军的指挥所——那座位于山前的宏伟庙宇最终还是被如狼似虎的官兵们给攻破了。起义军不得不且战且退，一直撤到了山上。他们占据着从南天门到北大光崖这一带的险要地势，居高临下地与官兵展开了殊死搏斗。然而，由于双方兵力悬殊过大，而且起义军的武器装备也远远不如官兵精良，尽管他们英勇无畏地抵抗，但终究还是无法扭转战局。终于，在八日清晨的时候，起义军的防线被官兵彻底击溃。
不过值得庆幸的是，这些起义军对当地的地形非常熟悉。于是，他们巧妙地利用了官兵难以行走的山顶路径，一路狂奔到了山北头，并成功地从北鞍口逃脱了敌人的追捕。
当厉应九撤退到北头大光崖的时候，他发现自己已经走到了绝路，前方再也没有可以前进的道路。就在这千钧一发之际，只见他身手敏捷地骑在了手中紧紧握着的花枪腊杆子上，然后双脚用力地紧踏着陡峭的光崖，就这样顺着光滑的崖壁飞速地滑落了下去。令人惊奇的是，他恰好落在了一个堆满了松软沙子的冲水坑里，竟然毫发无损。随后，他迅速地藏身于周围丛生的茂密荆棘之中，躲过了一劫。
待官兵如潮水般撤离之后，厉应九趁着如墨的夜色，像幽灵一般悄悄地离开了这个危机四伏之地，消失在了茫茫黑夜的深处。
这场惨绝人寰的战争结束后，战场上呈现出一幅如修罗地狱般凄惨悲凉的景象。到处都是被俘获的义军战士的尸体，横七竖八地躺满了整个山野，仿佛是被收割的麦穗，鲜血汇聚成猩红的河流一般流淌不息。那些不幸被俘的义军更是遭受了官兵惨无人道的酷刑折磨，其痛苦之状犹如被千万只毒虫啃噬，简直让人不忍直视。
厉应九一家如丧家之犬般讨饭到了诸城，隐姓埋名才勉强保住性命，尔后如浮萍般流亡到烟台、吉林等地，事件平息三年后才如惊弓之鸟般潜回家乡，于清光绪三十三年（公元 1907 年）在贫病交加中病逝。
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