这天晚上，天空一颗红色流星划过。原来是佐拉的种子由从宇宙飘到地球。
第二天善良的小姑娘真理子发现了一颗像蒲公英一样的种子，认为是某种花的种子。于是将其种在了花圃里面，希望其能开出漂亮的花朵。然而这颗种子其实就是昨晚宇宙飘来的佐拉种子。
佐拉其实是宇宙仿植物怪兽，身上散发出怪兽特有的电波，被UGM的探测雷达发现，但由于佐拉还处于种子状态，因此电波反应很弱，无法精确定位。UGM只能加大搜索力度警戒。
在几天之内，佐拉的种子吸收土壤的养分以及大量氧气而快速成长，甚至可以捕食鸟类补充营养。
矢的猛来到女孩真理子的花圃看望真理子时，发现了佐拉的种子，准备将其消灭。然而在真理子恳求下，只好暂时停手。于是布好监控，随时监视佐拉的种子。
UGM通过监视发现佐拉的种子越长越大，并且不进行光合作用，反而和动物一样吸收大量氧气吐出二氧化碳，使得花圃里的花都枯萎了。
矢的猛赶到现场查看，发现真理子晕倒在花圃边上。矢的猛上前查看真理子，结果佐拉对着矢的猛喷出黄色的有毒气体。矢的猛带着真理子躲开，并开枪还击。
在设定里佐拉吸收了镭射枪的能量而巨大化。可是这个一点都不合理！镭射枪能有什么威力？打个怪兽连皮都打不破，结果佐拉凭借这么点能量就能巨大化？小编觉得应该是佐拉在这几天已经成熟，平时是小型化迷惑猎物，然后喷出黄色毒气使生物昏迷，方便捕食。被攻击后就会显现出巨大化的本体。
巨大化的佐拉身高60米，体重3万吨。顶部的花状嘴中可以喷出黄色毒气。是一种植物型的动物，外表和能力都具有植物的多种特征，但本质上还是动物。
佐拉受到矢的猛开枪射击，开始巨大化，并开始攻击城市。
UGM出动战斗机队进行攻击，结果被佐拉用藤蔓悉数击毁。
杨光学习大古，发挥亡牌飞行员的特色，英勇地对着佐拉发动攻击，然后如愿以偿的被佐拉一鞭子抽得失去平衡，在坠机之前变身为盖德奥特曼登场。
佐拉的实力不算很强，能力也比较少。对上盖德那是毫无胜算。盖德右手凝聚八分光轮冲到佐拉身前，唰唰唰就是一顿挥砍，将佐拉全身的藤蔓砍断，佐拉威胁程度大减！
佐拉没有了藤蔓，只好喷出黄色毒气攻击盖得。
盖德直接一个跳跃来开距离，并蓄力一发盖德光线彻底杀死了佐拉。
盖德：“谁还不会远程攻击似的！”
并用特殊的治疗光线将真理子花圃里枯萎的花救活。看到真理子露出开心的笑容，然后夏啊～的一声飞走了。
之后没平静多少日子，在太平洋区域，连续出现了好几次船只失踪案。
这引起了UGM的关注。于是大山队长安排了巡逻警戒，并派战机护卫进出东京湾的运输船。
几天后，矢的猛驾驶的战斗机和石油运输船日精丸号被袭击。日精丸上除了船长以外，其他船员都坐救生艇成功逃离。而矢的猛跳伞成功，落入海里，被日精丸号的船员救了起来。
回到总部没多久，日精丸号的山本船长大难不死，通过无线电告知了UGM关于袭击的真相。
原来一切都是废弃幽灵船巴拉克什布造成的。幽灵船就是15年前的皇后号，它是一艘由最新型计算机控制操作的无人驾驶货轮，船上的货物为MK合金。
当年，皇后号在经过麦哲伦海峡时因撞击冰山而沉没。可能中心计算机由于撞击的缘故导致线路错乱从而失控暴走，15年来一直没有停止工作，潜伏在海底重新编程。如今编程完成，继续按照15年前设定的航线继续前进，从麦哲伦海峡前往东京湾。
在路途中，袭击了好几艘船只，并利用MK合金发出的强磁力将那些船只吸引到自己身上，成为自己的一部分。
UGM得知真相，开始组织救援任务，由矢的猛和杨光前去救援。当成功救出了山本船长后，出动宇宙战舰攻击幽灵船巴拉克什布。
巴拉克什布的智能计算机利用其所吸附的战列舰的导弹和火炮与宇宙艇火拼，成功将宇宙艇击落。
矢的猛抢在杨光之前变身为爱迪奥特曼，和巴拉克什布展开对轰式作战。
爱迪：“嘿嘿，这次被我抢先了吧，我总不能在自己的TV里真的变成个副奥吧！”
爱迪奥特曼飞在空中，速度极快。幽灵船无法打到爱迪，反而被爱迪用射击光束重创巴拉克什布的船身，最后再用沙库修姆光线炸毁了巴拉克什布，又一次轻松的维护了和平。
之后出现的怪兽是加哲拉，其真身是由住院需要做手术的少年建一制作的怪兽玩具。身体零件的来源更是五花八门，加哲拉口中安装的是建一父亲丢掉的打火机。胸口的增幅器原本是收音机的内部装置，而双手由其他玩具和生活用品组成。建一还制作出了加哲拉的投影仪，用来在夜间恶作剧惊吓医护人员。
那建一为什么要这么做呢？
原来建一需要做手术，但手术成功率只有15%，所以建一对此有了恐惧心理。每当要安排做手术时，建一就用投影仪在晚上投影怪兽的影像，使人们造成恐慌。这样就可以推迟手术时间了。
而巧合的是游荡西山医院附近的怪兽之魂正好附身到了建一放在海边的加哲拉模型上，使加哲拉成为了真的怪兽。受到惊吓的建一以棍棒攻击加哲拉，但冲击力的能量被增幅器吸收，让加哲拉变得跟成年人一样大。
建一赶紧逃跑，然后打电话到UGM。大山队长派矢的猛和杨光过来调查。两人来到医院，找到建一，在建一的带领下来到海边。然后真的看到有怪兽。于是拔枪就射，将怪兽加哲拉击落悬崖，掉落到海里。
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