由于小萌实在不想对这个神秘人想探一个究竟，古代这边信息又有限，于是她心里计划打算回一次现代，毕竟现在叶逸尘这边也和这个神秘人比较默契，他们也可以暂时可以避免被神秘组织追踪查到位置，而且他们也可以在古代继续准备一些未来备战的武器装备等。
小萌就说:“我打算回次现代，你们继续在这边部署和安排吧，光靠我们这一点点人可能还是对抗不了神秘组织，还得去现代和部队领导们沟通协商一下也和他们沟通交流一下意见。”
神秘人倒是无所谓的是：“也可以吧，不过你自己注意安全，不要被神秘组织知道你的行踪。”
叶逸尘也说:“可以，不过你一定要注意安全，不能心急，毕竟神秘组织太强大我们也得一步一步来。”
小萌说：“没事，我会保护好自己，也会安全到现代和那边队伍沟通拿出方案来。”
小萌转身踏入了时空穿梭通道。一阵眩晕过后，她出现在熟悉的现代都市街头。周围车水马龙，人们行色匆匆，一切看似平常却又危机四伏。
小萌小心谨慎地朝着部队总部走去。然而刚走到半路，她就察觉到有人跟踪。她故意走进一条小巷子，突然转身，对着空气喊道：“出来吧，跟了这么久不累吗？”只见阴影处缓缓走出几个黑衣人，正是神秘组织的爪牙。
小萌暗自叫苦，但面上不显，冷静道：“你们想干什么？”其中一人冷笑：“你觉得我们会放你离开？今天就是你的死期。”说着便向小萌攻来。小萌奋力抵抗，就在她快要抵挡不住时，一道强光闪过，一群身着部队装备的军人出现将黑衣人团团围住。原来是军方早有防备，暗中派人保护小萌。黑衣人见状不妙，四散而逃。小萌松了口气，随着军人前往总部商讨对抗神秘组织的方案。
到达总部后，小萌立刻被带到会议室。会议室内气氛严肃，部队领导早已等候多时。小萌将古代的情况详细汇报，并提出神秘人的存在是个关键因素。众人陷入沉思，这时一位军人说：“这个神秘人身份必须尽快查明，如果他是敌人，我们将会很被动。”不管怎么样，安排一些人手对神秘人查阅了解情况，也安排了现代专业人员配合随小萌再次穿越回古代了解情况，一方面协助叶逸尘等人，另一方面调查神秘人。小萌带着小队通过时空穿梭通道返回古代。叶逸尘看到小萌平安归来，还带来了帮手，心中大喜。众人开始重新规划战略布局。小萌则说我带他们过来是协助你们，然后我还得回现代了解神秘组织在现代的发展情况和现代队伍计划对付现代那边的情况，然后小萌也交代给了现代过来的队伍秘密关注神秘人的情况，方便后面他们回现代给领导汇报。神秘人说：“后面你干脆做我们和现代那边的联络负责人我觉得挺合适的。”
小萌倒是开心的说：“那倒是没有问题，义不容辞了，只要可以让神秘组织不存在，还大家一个和谐安定的社会，我当然也是愿意了。”
小萌再次踏入时空穿梭通道返回现代。这次她更加小心翼翼，时刻警惕着神秘组织的袭击。回到现代后，小萌深入调查神秘组织的据点分布。经过一番周折，她发现了一个疑似神秘组织高层聚会的地点。
小萌决定潜入这个疑似神秘组织高层聚会的地点。她换上一身黑色紧身衣，利用夜色的掩护悄悄靠近。透过窗户，她看到里面的人都戴着面具，看不清面容，但从他们的服饰和气场来看，都是些极难对付的角色。
小萌小心翼翼地拿出微型窃听器，试图贴在窗沿下偷听他们的谈话内容。正当她要成功之时，一只手搭在了她的肩膀上。小萌一惊，转头一看，却是之前在部队总部见过的一位擅长潜伏侦查的军人。原来部队领导担心她独自行动危险，特意派这位战友前来协助。
两人相视一笑，继续监听屋内动静。他们得知神秘组织即将有一场大动作，目标竟是古代和现代同时发动攻击，企图一举摧毁所有反抗力量。小萌深知事情紧急，立即和这个军人返回总部报告。部队领导迅速做出应对策略，加大两边时空的防御力量，并且设下圈套等待神秘组织自投罗网，小萌也做好准备随时再穿梭古今传递消息协调作战。
对啦，忘了重要事情，古代那边有安排的部队人员了解关心神秘人的情况，小萌心想，现代这边也不能不查，她自己也是通过资料查询和现代信息情况对这个神秘人进行核实。
小萌开始从神秘人出现的时间线着手查询。她发现每次神秘人出现都会伴随着一种特殊的能量波动，这种波动与神秘组织某些机密研究中的数据有微妙联系。
小萌顺着这条线索追查下去，竟发现神秘人的真实身份可能与神秘组织有着千丝万缕的关系，但又似乎有着更深层次的矛盾。她推测也许神秘人曾经是神秘组织内部的反叛者，掌握了核心机密才被迫逃离。
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