医疗部的主要责任是对内培养医疗忍者以及研究医疗忍术，出于对医疗忍术的保密性，一般的医疗都不会在医疗部内进行，只有伤势非常严重或是有着特殊病症的伤员会送入医疗部内，正常情况伤员或病人接受治疗的地方是在木叶医院——
医疗部所培养出来的新人都会到木叶医院内实习，以积累经验，如果不是有着出色的医疗天赋以及强大的医疗水平，其医者也不会留在医疗部内，而是被安排到木叶医院里作为资深医者或是管理层。
简单来说，医疗部就是精英医疗忍者所聚集的地方，而寻常的医疗忍者都会到木叶医院里任职。
虽然木叶医院是刚刚建立起来的新建筑，此前未有先例，但是医疗忍者们在第一次忍界战役中所获得的经验，以及风森正辉所建议的系统化，让木叶医院已经有了一个很好的体系，虽然显得稚嫩，但已足够完整，以后只要慢慢扩展即可。
对于忍者村内的平民而言，他们是第一次见识这种新奇的地方，要知道，大部分的人都没有见过真正的医者，生病的时候只能用些土方子，病情轻的就熬过去了，病情重的，有医者在的小镇里还好说，那些偏远山村的就只能看运气了。
而现在，木叶医院有着远超出他们想象的医疗水平，往常在他们看来是绝症的病，医疗忍者们轻轻松松就解决，连喘气都不带一下，毕竟是没有见过大场面的平民，一些只是稍微有些严重的病就大惊小怪的，其中虽然也有一些比较棘手的，但是如今的木叶医疗部可是连雨之国的那些疫病都撑过来了，还怕什么？
雨之国的那次经历给木叶医疗部提供了非常宝贵的经验，雨之国向来是疫病高爆发的地段，前去的医疗忍者不知道承受多少痛苦，方才控制住雨之国的疫病传播，对当时的雨之国平民来说，不知道有多欢喜，对于木叶忍者村也是感激涕零。
在忍界战役期间，雨隐忍者村对于木叶忍者村派来的医疗忍者虽有微词，但还是对其大开方便之门，然而，随着忍界战役的落幕，雨隐忍者村那位多疑的首领就渐渐改变了态度，他一直都觉得木叶忍者村不怀好心，肯定打算搜集雨隐忍者村的情报，在日后就可以对雨之国处于优势。
木叶忍者村确实不是在做慈善，雨之国的位置独特，位于三国之间，是非常重要的交通要道，因为多雨的气候，雨之国内部农业惨淡，所以依赖他国进口。木叶忍者村的援助，一方面是打算搜集医疗数据，为医疗部填充案例，一方面就是交好雨之国，这个交通要道要是掌握得好，对遏止风之国与土之国都是有利的。
雨隐首领未必就是看出木叶忍者村的目的，或者说，就算看出来了，他也不打算认命，对于这些强大的国家，出身卑微的他向来都是抱有敌意的。
虽然雨隐忍者村不敢挑衅木叶忍者村，但对于医疗忍者的限制是越来越多，但后来就是不得允许就无法行动，让这些因为雨之国的惨状而多多少少抱有怜悯的医疗忍者是心冷了起来，幸好有半藏在从中周旋。
忍者村是注重上下级关系的组织，木叶忍者村因为和谐发展的缘故，会有所松懈，上下级关系很友好，但在雨之国这种地方，雨隐忍者村的等级关系就是固若金汤，即便半藏有着强大的实力，也不能违反忍者村的命令，除非他打算篡夺忍村的权利。
所以，半藏对于这些救助自己国家民众的医疗忍者很抱歉，在木叶忍者无法忍受，打算离开的时候，他也没有多加劝阻，他知道这是自家忍村的首领喜闻乐见的。
在木叶忍者离去后，半藏还特意写了一封信，让木叶忍者带回去，不论是给风森正辉看还是二代火影看都可以，表示自家是很希望跟木叶忍者村交好的。当然，因为这件事，让半藏在雨隐忍者村内的处境更加不好，基本上是跟着雨隐首领对着干，要不是因为半藏的实力惊人，雨隐首领早就动手了。
风森正辉知道这件事后，就跟扉间商议是不是要支持半藏上位，一个抱有敌意的忍村首领跟一个亲木叶的忍者首领，所能带来的益处显然是两回事，但因为现在是五影协议所规定的十年和平期，在这段时间里谁也不能干涉小国，所以暂时搁置。
风森正辉就是不知道在五国制衡的十年里，半藏会不会从那位雨隐首领的身上接过忍村的权利，至少在原本的历史里是如此，只要没有其他人去干涉，半藏迟早也会得到雨隐忍者村的首领位置。
当然，那时候风森正辉可不打算让木叶忍者村跟雨隐忍者村交恶，而是双方联手，即便第二次忍界战役爆发，木叶忍者村这边也会显得轻松些，不必面对传说中的半神的压力。
走进木叶医院里，风森正辉可以看到一些前来看病的平民或是忍者，因为扉间有引诱平民去当忍者的想法，木叶医院和忍者学校的福利是很不错的，一般的平民都负担得起，那些为木叶奋战而死的英烈后裔也都会得到优待。
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