小智一行人终于抵达了以香水和花卉闻名的彩虹市。
这里到处都是五颜六色的花朵，空气中弥漫着阵阵清香。
“哇，这里就是彩虹市吗？好漂亮啊！”小霞忍不住赞叹道。
“是啊，”小刚深吸一口气，“空气里都是花香，太棒了！”
娜姿也好奇地四处张望，她能感受到这座城市里充满了平和而充满生机的能量。
小智看着眼前美丽的城市，却没有立刻去挑战道馆的意思。
“大家，我们先不着急挑战道馆。”小智说道，“我想先让伙伴们进行特训，为接下来的挑战做准备。而且，我也想调整一下队伍。”
队伍调整与特训
在一家安静的宝可梦中心，小智拨通了大木博士的视频电话。
“博士，我想和您交换一下宝可梦。”
“哦？又有新想法了吗，小智？”大木博士的声音依旧充满活力。
“是的，我想把大针蜂和尼多王还有卡咪龟,火爆猴暂时送回研究所，然后把火恐龙和比比鸟接过来。”
“好嘞！”大木博士笑着说，“你的伙伴们在研究所都很健康，随时可以为你待命！”
随着两道红光闪过，大针蜂和尼多王还有卡咪龟，还有火爆猴被传送回了研究所。紧接着，火恐龙和比比鸟兴奋地出现在了小智面前。
“吼！”（我回来了，小智！）
“比——比——！”（终于又能和你一起旅行了！）
小智开心地摸了摸它们的头，然后宣布：“特训开始！”
在彩虹市郊外一片开阔的草地上，小智的宝可梦们展开了激烈的对战训练。
皮卡丘的电光一闪更加迅捷，火恐龙的喷射火焰也愈发炽热，比比鸟的烈暴风威力十足。
而妙蛙种子则在一旁默默地进行着体能训练，它的动作沉稳有力，每一次跳跃和撞击都充满了力量。
偶遇训练家与妙蛙种子的异常
一天，在特训时，一个名叫阿龙的训练家主动找上门来挑战。
“你就是那个打败了娜姿的小智吧？我想和你切磋一下！”阿龙自信地说。
“好啊！”小智欣然应允。
对战开始，阿龙派出了他的主力宝可梦——一只强壮的穿山王。
小智思索了一下，决定派妙蛙种子上场。
“妙蛙种子，就决定是你了！”
“妙蛙！”
战斗进行得非常激烈。穿山王的速度极快，不断用“高速移动”接近妙蛙种子，并用“劈开”进行攻击。
妙蛙种子则凭借着“飞叶快刀”和“藤鞭”进行远程反击，同时用“变硬”来增强防御。
就在双方打得难解难分的时候，奇妙的事情发生了！
妙蛙种子背上的绿色花苞突然开始闪烁起柔和的白光！光芒越来越亮，甚至盖过了战斗的激烈。
“那是……”小智和阿龙都停下了指挥，惊讶地看着妙蛙种子。
乔伊小姐的指点
看到妙蛙种子的异常，小智立刻抱着它冲向了最近的宝可梦中心。
乔伊小姐仔细检查了一番，脸上露出了惊喜的表情。
“小智，恭喜你！你的妙蛙种子不是生病了，它是要进化了！”
“进化？真的吗？”小智兴奋地问。
“是的，”乔伊小姐点了点头，“但是，它的情况有点特殊。它积累的能量非常庞大，普通的进化可能无法完成。”
“那怎么办？”小霞着急地问。
乔伊小姐想了想，说：“彩虹市有一个叫做‘不可思议花园’的地方。那里生长着许多特殊的植物，每年都会有很多妙蛙种子和妙蛙草在那里进化。花园的首领是一只传说中的‘霸主妙蛙花’，它拥有非常强大的生命能量。或许，只有在那里，你的妙蛙种子才能顺利进化。”
前往不可思议的花园
根据乔伊小姐的指引，小智一行人来到了彩虹市深处的不可思议花园。
这里简直是植物的天堂，巨大的花朵随处可见，空气中充满了浓郁的生命气息。
花园里已经聚集了几只正在等待进化的妙蛙种子和妙蛙草。
在花园的最中央，一棵巨大的古树之下，一只体型异常庞大的妙蛙花静静地坐着。它的背上开满了鲜艳的花朵，周身散发着令人敬畏的气息——它就是霸主妙蛙花。
霸主妙蛙花缓缓睁开眼睛，目光落在了小智和他的妙蛙种子身上。它能感受到妙蛙种子体内那股蠢蠢欲动的巨大能量。
跨越两阶的进化！
小智将妙蛙种子轻轻放在地上。
“妙蛙种子，去吧，在这里完成你的进化！”
妙蛙种子回头看了看小智，眼中充满了感激和决心。它朝着霸主妙蛙花的方向走去。
当它走到霸主妙蛙花面前时，身上的光芒再次亮起。这一次，光芒比之前更加耀眼！
妙蛙种子的身体开始发生变化，它的体型逐渐变大，背上的花苞也在慢慢膨胀。
然而，就在它即将进化成妙蛙草的那一刻，光芒突然停滞了，似乎有一股无形的力量在阻碍着它。
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