“监察处必须严格执法，比如学员不得私自逃课，不得抢夺他人修炼资源，教职工不得偏袒学员，一旦发现违规，要按《学院奖惩条例》处理。” 凌玥严肃地说道，“学院是培养人才的地方，必须保证公平公正，不能让歪风邪气影响了学风。”
管理体系搭建完成后，最关键的教学体系完善正式开始。按照之前确定的方案，学院分为战斗部、丹药部、兵器部、阵法部、种植部、饲养部六个部门，其中战斗部为必修主修科目，其余五个部门为辅助科目，学员需任选至少两个辅助部门学习，立志培养全能型人才。
战斗部的课程设置最为全面，从基础的气血运转、灵力操控，到进阶的体兵使用、阵法配合，再到高阶的实战演练、域外敌人应对，都有详细的教学计划。初等班学员主要学习《基础气血诀》和《体兵入门》，每天清晨在演武场练习扎马步和基础枪术、剑术；中等班学员学习《进阶气血阵》和《实战技巧》，每周进行一次模拟战斗，对抗由教职工扮演的 “域外敌人”；高等班学员则直接参与实战任务，跟随深域巡逻队行动，在真实战斗中积累经验。
负责战斗部教学的林风，每天都会亲自指导学员练习。他手持圣剑，在演武场上演示基础剑招：“出剑时要注意气血与灵力的配合，体兵不是单纯的武器，而是身体的延伸，只有将气血注入体兵，才能发挥出最大的威力。” 说着，他一剑劈开身前的巨石，剑气中带着淡淡的气血红光，巨石瞬间碎成粉末。
丹药部的课程则分为理论和实践两部分。理论课上，教职工会讲解灵草的属性、丹药的配方和炼制原理，比如 “愈魂丹需要用玄冰草和灵参作为主料，炼制时火候要控制在中温，否则灵参会失去药效”；实践课上，学员们在炼丹房内操作小型丹炉，从最基础的 “凝气丹” 开始炼制，逐步过渡到 “镇蚀丹”“破蚀丹” 等高阶丹药。
林小婉作为丹药部的骨干教师，每天都会在炼丹房指导学员。她看着一名学员将灵草放入丹炉，立刻出声提醒：“灵草的投放顺序很重要，要先放玄冰草降温，再放灵参提效，最后放虚空草稳定丹药属性，顺序错了，丹药很容易炸炉。” 果然，那名学员刚将灵参先放入丹炉，丹炉就冒出黑烟，林小婉连忙用灵气护住丹炉，才避免了炸炉事故。
兵器部的课程则侧重于体兵的锻造和维修。初等班学员学习识别矿石属性，比如 “虚空钢适合打造抗蚀战甲，蚀吸矿适合打造体兵武器”；中等班学员学习基础锻造技巧，在炼器坊内用小型熔炉打造简单的匕首、拳套；高等班学员则挑战复杂的体兵锻造，比如能在虚空环境中使用的 “破虚枪”，甚至参与学院定制体兵的研发。
灵匠宗的墨老带着学员在炼器坊内锻造体兵，他手把手地教一名学员捶打虚空钢：“捶打的力度要均匀，每一击都要注入气血，这样才能让虚空钢的抗蚀属性更好地发挥出来。你看，这处纹路要是捶打不均匀，战甲就会出现薄弱点，在深域很容易被腐蚀能量穿透。”
阵法部的课程则涵盖了阵法的绘制、布置和破解。学员们不仅要学习基础的聚灵阵、防御阵，还要学习进阶的反蚀阵、虚空阵，甚至高阶的天地转化大阵。实践课上，学员们在学院的空地上用阵旗和灵晶布置阵法，教职工会模拟域外能量冲击，检验阵法的稳定性。
万法宗的秦越带着学员布置聚灵阵，他指着阵眼处的灵晶说道：“阵眼是阵法的核心，灵晶的品质直接影响阵法的效果。聚灵阵用中品灵晶就能满足需求，但反蚀阵必须用上品灵晶，否则无法抵御虚空腐蚀能量的冲击。另外，阵旗的摆放角度也要精准，偏差半寸，阵法的威力就会降低三成。”
种植部的课程则围绕灵植的培育、改良和病虫害防治展开。学员们在灵植园内学习种植灵稻、灵麦、灵草等作物，掌握虚空土的使用技巧，甚至尝试用深域的星露泉水改良灵植品种。比如，他们将普通灵稻与深域带回的 “金穗稻” 杂交，培育出了成熟期更短、灵气更浓郁的 “双优灵稻”。
李壮带着学员在灵植园内查看灵稻的生长情况，他蹲在田边，拔出一株灵稻，指着根部的白色菌丝说道：“这是‘灵根菌’，能帮助灵稻吸收灵气，但如果菌丝过多，就会争夺灵稻的养分，导致灵稻枯萎。你们要学会判断菌丝的数量，过多时就要用稀释的灵泉水浇灌，抑制菌丝生长。”
饲养部的课程则包括妖兽的驯化、喂养和疾病防治。学员们在妖兽栏内饲养灵兔、灵鸡等低阶妖兽，学习如何用灵植喂养妖兽，如何通过气血交流驯化妖兽，甚至尝试训练妖兽进行简单的劳动，比如让灵兔帮助搬运灵草，让灵鸡帮助清除灵田内的害虫。
负责饲养部教学的是灵农宗的一名长老，他带着学员给灵兔喂食：“灵兔喜欢吃新鲜的灵麦叶，但不能喂太多，否则会消化不良。每天喂食三次，每次一小把，还要定期用灵泉水给灵兔洗澡，这样能减少疾病的发生。另外，驯化灵兔时要耐心，用气血轻轻抚摸它的毛发，让它熟悉你的气息，时间长了，它就会听从你的指令。”
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