在大陆最北部的（睿智湖）、最西部的（心齐湖）、最东部的（立志湖）是湖之守护者居住的地方。在立志湖附近还隐藏着第四个湖，居住着骑拉帝纳的送泉。
因为神奥地区面积过大，所以整个地区被天冠山分成了两个部分，和关都地区、城都地区的组成方式相比，还是很相似的。由于这个缘故，无壳海兔和海兔兽出现了地域隔离而产生不同形态的例子，在山东面的是蓝色，而西面的是粉色。
神奥西部地区地表复杂。它的海岸线明显比东岸要陡峭险峻，但其土地相较而言却肥沃得多。
大部分的城镇都是村庄。它拥有一个经常刮风的峡谷，这个峡谷被来源于天冠山的河流侵蚀。
一座向周边城镇供应清洁的风力电气资源的山谷发电厂坐落于此。但这并不意味着西部地区就毫无意义可言，像黑金市、百代市和水脉市是道馆的所在地，而西边的中心地带祝庆市，是整个地区科技最发达的城市，也是神奥地区的中心城市。
神奥东部地区充满着生活气息，并且有着各种各样的设施，例如家缘市的宝可梦华丽大赛会场，帷幕市的帷幕百货公司，湿原市的大湿地，滨海市的导航灯塔。这些城市里也都有道馆，对于联盟挑战者来说也是旅程中的必经之地。
从西北方向看到的天冠山山顶，山顶上面是毁坏的世界的入口
不同于被天冠山纵向分开的东西部地区，北部地区人烟稀少，主要区域只有雪峰市。可能因为从天冠山山顶吹下的雪的缘故，使得北部地区不仅寒冷，而且向北部行进的路程非常艰险。尽管相对孤立，但雪峰市仍然拥有自己的道馆，使其成为希望挑战宝可梦联盟的训练家的重要一站。
第三个重要的分地区是对战特区，位于神奥大陆东北方的巨大岛屿上。就像来自七之岛的人们认为他们的家是独立于关都和城都的地区一样，来自对战特区的人们也认为自己所在地区和神奥地区是互相独立的。
包括新月岛、满月岛、钢铁岛在内的几个岛屿分布在神奥西北沿海，当然其在大小和重要性上都远逊于神奥大陆。
自古以来就有很多的城镇存在，居民都比较相信神话传说，也有的镇子放有古代宝可梦的铜像。城镇的整体规模要比前作大。算上对战特区的3个小区域，一共有15个城镇。
深奥地区白浩天并没有去过，但是他基本上很了解，包括这里选择的初始精灵。
李美琪：“我知道荒井在哪，好像在百代市附近的百代森林。”
崔甜甜：“啊！那里和其他地方的森林一样，百代森林是许多虫属性，森林看起来很荫郁。”
崔甜甜听到要去这里有些迟疑，毕竟她不是很喜欢虫系精灵宝可梦。
李美琪：“难道你要做叛徒吗？”
李美琪看着崔甜甜好像这事情就没有商量，不能打退堂鼓。
虽然比较为难，但是闺蜜都这样说了，崔甜甜只好同意。
看来躲是躲不了了，只能勇敢的面对。
李美琪：“刚好小火也累了，带他们散散心。”
白浩天一阵无语，这能不累吗？天天想着下蛋，也不知道最近怎么样了。
不过话说回来，喷火龙是怎么下蛋的呢？难道和母鸡一样？
此刻的李美琪和崔甜甜盯着白浩天，感觉这个男生一定脑子里又想什么东西了。
白浩天：“嘿嘿，上课吧！”
白浩天注意到这两个人的眼神，有些尴尬，最近也不知道怎么总是对这些莫名其妙的事情感兴趣。
李美琪：“我回家收拾下，我们这个周末出发。”
白浩天：“好吧！”
白浩天只好点头同意，毕竟李美琪做事还是比较雷厉风行，别看他美若天仙，但是做事却是一点都不马虎，甚至还有人给她起了天才小仙女的称号。
白浩天回到学校，大家更是对这对神仙情侣充满了期待大多数的话题都是白浩天无敌三秒哥技能的时间，原以为这只是一阵风就过去了，可是万万没想到，这件事情一发不可收拾，甚至这个称号成为一个潮流。
白浩天的名气也变得家喻户晓，甚至有的人直接称呼他为三秒哥。
白浩天每当听到这样的称号时，只能尴尬一笑。
李美琪：“那个……我妈让你今天去我家吃饭。”
白浩天：“我很愿意。”
李美琪听到白浩天这么厚脸皮，嘴上说他不要脸可是心里却是小激动。
李美琪：“你回家收拾干净一点。”
白浩天：“知道了。”
白浩天连连点头，这可是要见岳父岳母了，不激动才怪，吃完饭说不定还有其他的活动……
李美琪：“吃完饭，我们就要出发了，崔甜甜也一起来。”
崔甜甜：“没错谁让我俩青梅竹马。”
白浩天：“啊！”
白浩天还以为是二人世界，这次可好崔甜甜又冒了出来，看来这个小丫头是刻意出来搅局了。
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