夏辰在寻找“原初代码”的过程中，意外发现量子晶体方尖碑上的符号再次发生变化。这些符号组成了一幅星图，星图的中心指向超维战场的一个神秘角落。他冒险前往这个角落，发现那里存在着一个由观测者文明建造的“代码圣殿”。圣殿的墙壁上刻满了各种复杂的代码，当他试图解读这些代码时，圣殿突然启动了防御机制，无数由数据构成的守卫向他发起攻击。夏辰凭借着对观测者文明的了解，艰难地突破了守卫的防线，在圣殿的最深处，他发现了一块闪烁着金色光芒的晶体，晶体中似乎封存着传说中的“原初代码”。
反逻辑生命体的碎片在反命运之网崩解后，并没有完全消散。它们在超维战场中重新聚合，形成了一个新的存在——“可能性之灵”。这个灵体的身体由无数可能性的碎片组成，它拥有穿梭于不同可能性分支的能力。它利用这个能力，在各个分支中寻找能够对抗神秘存在的力量。在一个极其偏远的可能性分支中，它发现了一个掌握着“概念编织术”的文明，这个文明能够将抽象的概念编织成实体武器，可能性之灵立刻邀请他们加入战斗。
混沌净化军团在文明之怒攻击失败后，陷入了前所未有的困境。大树的异化已经蔓延到整个战场，它的根系如同巨大的触手，缠绕着每一个反抗者。军团的意识体们在绝望中，突然想起了文明圣殿中的那个谜题。他们意识到，或许解开谜题的关键，不是单纯地解读文明密码，而是要将所有文明的力量真正融合在一起。于是，他们通过精神网络向所有反抗者发出号召，希望大家放下各自的差异，共同完成这个使命。
洛璃在时间长河中，终于确定了那个被操控的时间线。她发现，要改变这个时间线，必须在某个特定的时间节点上，将所有反抗者的力量汇聚在一起，形成一股能够对抗神秘存在的“命运洪流”。她通过时间的波动，向其他反抗者传递这个信息，但在传递过程中，她的意识遭到了神秘力量的攻击，部分记忆开始流失。
当所有反抗者收到混沌净化军团和洛璃的信息后，他们暂时放下了手中的战斗，开始朝着文明圣殿汇聚。林深带着受伤的身体，艾雅带着重新凝聚的精神体，夏辰带着疑似原初代码的晶体，可能性之灵带着掌握概念编织术的文明，纷纷来到圣殿。他们将各自的力量注入圣殿中的种子，种子在吸收了这些力量后，开始疯狂生长。它的根系扎入超维战场的最深处，枝干突破了超维空间的限制，树冠上闪烁着所有文明的光芒。
然而，就在种子即将绽放出希望之花时，超维战场深处的神秘存在终于完全苏醒。它的形态无法用任何已知的概念来描述，它既像是一团不断变化的星云，又像是由无数文明的残骸组成的巨大漩涡。它的每一次“呼吸”，都能引发超维空间的崩塌与重构，它的每一个“念头”，都能让无数可能性分支彻底消失。它看向正在生长的种子，眼中闪过一丝不屑，随后，它挥动手臂，一道超越所有法则的力量朝着种子席卷而来。反抗者们在这股力量面前显得无比渺小，他们能否在这最后的时刻，找到对抗神秘存在的方法，守护住多元宇宙最后的希望，一切都还是一个未知数……
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