机械天道议会则启动「灵能科技融合计划」。艾塔带领团队拆解修真者的法器构造，逆向研发出「灵能驱动核心」。这种核心将灵气转化为可控能源，安装在星舰上后，不仅使航行速度提升三倍，还能在遭遇空间乱流时，自动运转类似「护盾法术」的能量屏障。在一次穿越猎户座暗物质带的任务中，装备灵能驱动核心的「天道探索者号」，仅凭核心自发形成的灵气护盾，便抵挡住了暗物质的腐蚀，震惊整个科学界。议会还将灵能科技应用于民生领域，在多个星球建造「灵气生态城」，悬浮的建筑由灵脉支撑，城内居民既能享受科技便利，又能吸收改良后的灵气进行日常修炼。
时间观测者联盟发现，九霄天域的「渡劫」现象与时间维度存在深层关联。渡劫时引发的天地异象，本质是修真者强行突破现有时间线的束缚，开辟新的可能性。露娜带领团队构建「渡劫时间模型」，通过分析先遣队带回的战斗影像，预测出渡劫成功概率与时间线稳定性的关系。基于此，联盟开发出「渡劫辅助仪」，实则是一种微型时间稳定器，能在修真者渡劫时，局部修正紊乱的时间波动。当一名来自三角座星系的天赋者尝试渡「大乘劫」时，辅助仪及时将即将崩溃的时间线重新编织，助其成为首个在宇宙中成功渡劫的非修真界生灵。
万灵精神圣殿对修真文明的「元神修炼」体系表现出浓厚兴趣。艾丽娅组织精神学者与修真界的神念大师展开跨界交流，发现修真者通过淬炼元神增强精神力的方式，与精神共鸣有着异曲同工之妙。双方合作创立「元神共鸣理论」，开发出「元神淬炼室」。该设施通过模拟修真界的「心魔试炼」场景，帮助修行者直面内心恐惧，强化精神壁垒。在仙女座某颗饱受精神污染的星球上，居民们通过元神淬炼室的训练，不仅清除了污染，还觉醒了类似「神识」的感知能力，能够提前察觉危险。
元素混沌学院将修真界的五行元素理论与宇宙元素体系融合，培育出全新的元素生命体。雷欧带领团队以混沌青莲的净化之力为引，让火元素生物掌握「三昧真火净化版」，其火焰不仅能焚烧物质，还能净化能量中的杂质；水元素生物进化出「玄冥真水」形态，可在液态、气态、固态间自由切换，且每种形态都对应不同的法术效果。在修复被暗物质破坏的星球时，这些新型元素生物组成「元素修真联军」，运用五行相生相克之理，快速重建生态系统。
然而，表面的繁荣下，新的危机正在暗处滋生。在宇宙与九霄天域的位面夹缝中，出现了诡异的「裂隙魔影」。这些魔影形似被拉长的人影，由位面摩擦产生的混沌能量构成，能够穿透任何物理防御，直接攻击目标的「灵智本源」——对修真者而言是元神，对其他生命则是意识核心。首个受害者是正在研究灵能科技的机械工程师，他在实验室中突然呆滞，所有的设计图纸都变成了扭曲的乱码，核心程序陷入无限循环的错误指令。
宇宙守护联盟迅速成立「位面裂隙调查团」。林宇通过混沌共鸣体质，感知到裂隙魔影与当初幽冥魔气的残留气息存在某种量子纠缠；无涯则发现这些魔影的行动规律暗合修真界失传已久的「混沌遁术」，能够在不同位面间瞬间移动。调查团在追踪过程中，意外发现了一处隐藏的位面黑市，黑市中流通着神秘的「混沌玉简」，玉简表面刻满的符文，竟能召唤裂隙魔影为使用者战斗。
深入调查后，真相逐渐浮出水面。原来，在九霄天域与宇宙融合的过程中，一些极端的修真者认为科技污染了纯粹的修炼之道，他们勾结位面夹缝中的古老存在，企图利用裂隙魔影制造混乱，进而夺回对九霄天域的绝对控制权。这些人组成「守道盟」，其首领「玄虚子」曾是青云宗的天才弟子，因追求力量误入歧途，他妄图通过收集混沌能量，重塑一个只存在修真文明的宇宙。
守道盟在各个位面节点布置「混沌聚魔阵」，阵法核心是被魔气污染的混沌青莲残片。当阵法启动时，位面裂隙会不断扩大，更多的裂隙魔影涌出。在一次突袭中，调查团发现了守道盟的一处秘密基地，基地内关押着大量被抽取灵智的生命，他们的能量被用来维持阵法运转。林宇与无涯带领众人展开营救，却遭遇玄虚子亲自坐镇。
玄虚子手持由九把魔化飞剑组成的「九霄灭世剑阵」，剑阵运转间，空间寸寸碎裂，时间出现倒流与加速的紊乱。他施展出禁术「元神万化」，将自己的元神分裂成无数个虚影，从不同角度发动攻击。林宇挥动混沌秩序终焉之匙，施展出「混沌秩序·万象归墟」，试图将剑阵产生的混乱空间重新归位；无涯则以青云剑诀迎战，剑气与魔剑碰撞，爆发出的能量形成了小型的灵气风暴。
艾塔指挥机械舰队发射灵能光束，却被玄虚子用「魔气吞噬诀」吸收转化；露娜发动时间禁锢，却发现玄虚子能通过裂隙魔影的特性，在时间牢笼中不断切换位置；艾丽娅的精神攻击遭遇玄虚子的「元神护盾」，护盾上的符文不断吞噬着精神力量；雷欧操控元素生物组成五行大阵，试图克制魔气，但玄虚子召唤出「混沌元素」，这些元素不受五行法则约束，肆意破坏大阵。
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