吕大山将两千米长的超圣五阶骨架送入机器进行提纯与加工。第一次加工后，骨架的长度缩减至二百米。吕大山觉得仍然过高，于是进行了第二次加工，最终长度降至十余米。尽管他仍觉得不够满意，经过第三次加工，骨架的高度最终定格在一米九八。吕大山对此表示满意，并根据《尸骨的加工与提纯制作分身法》的指引，开始在骨架上绘制阵法与经脉。这项工作由舍利子塔的器灵负责，舍利子塔在骨架的内外不断变大变小，以绘制相应的阵法。
智能小灵开始构建动态星际传送阵。在舍利子塔的二层，吕大山安装了第一个传送阵。智能小灵计划将一只混沌石葫芦传送至世界珠内。首先，它定位到世界珠，因为在世界珠内设有智能小灵所配置的主机，定位过程相对简单。随后，混沌葫芦成功传送过去。不久之后，智能小灵通过自身的信号收到了相应的回信。接着，它又将十套传送阵的相关部件传送过去，以便主体能够建立相应的传送阵。同时，智能小灵召唤了另一个混沌分身，向其定位并传送了一整套传送阵的零部件装置，指示其在飞蝶之中建立一个传送阵。不到两天的时间，智能小灵便在主机的三个飞蝶、世界珠、舍利子塔及金属分身的内世界中设立了星际传送阵，使得物品及各主体分身能够在其中自由传送。
舍利子塔的器灵在新制的骨架上绘制阵法的工作也迅速完成。与此同时，混沌分身开始逐渐融入骨架之中，控制骨架内的经脉运行《九五规则功法3》。经过一周天、二周天、三周天……直到一千周天，甚至一万周天，骨架上逐渐长出了肌肉、经脉、穴位和丹田等结构。穴位数量达到三百六十五个，经脉齐备，丹田宽广，唯独缺少元婴的填充。吕大山又向舍利子塔内传来了两千套五行珠，混沌分身在混沌石与舍利子塔的三层中各处建立了三个湖泊：一个装混沌液，一个装鸿蒙液，另一个作为灵魂与身体的清洗液。新形成的混沌身体在初期便一直坐在第三个池内修炼。修炼无岁月，转眼间一千年过去，身躯逐渐变得丰满，丹田与穴位内也形成了混沌元婴。此时，神识境界已达神宗境，修为也提升至神王初期。
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