而涿鹿之战则是黄帝执政时期另一场人族内战，与之前的炎帝一样，蚩尤所领导的九黎部落，实力日渐强大，不甘心遵循祖制听命于人皇，便带着自己八个亲兄弟，七十二个族兄弟，一共八十一个部落共同起兵叛乱，三皇依旧没有插手干预，而是让人皇黄帝自己处理，于是黄帝与炎帝联手，派兵前往镇压，这场战争的规模就要比之前的阪泉之战大得多，双方囤兵于涿鹿一地展开大战。
九黎一族九位兄弟各个神通广大，可呼风唤雨，实力不凡，一度将人皇黄帝的部队打得溃不成军，要说九黎部落为何实力如此之强，主要还是要怪当年张安之的决定，为了了结与巫族的因果，张安之让那些在巫妖量劫中战死的十二祖巫部落族人，投胎转世到人族，并且还用十二祖巫之命来命名新部落，随着这些巫族转世降生，十二个部落不断发展，最后人族之中便形成了一个新的部落，就是九黎部落，正因为是巫族族人转世而来，所以九黎部落之人大多好战，且天赋惊人，实力都比普通人族要强大得多，相比之下，人皇黄帝与炎帝则处于了劣势，双方在逐鹿大战九场，人皇一方九战不胜，最后好在有人族气运的加持，人皇黄帝发明了指南车，破了蚩尤的大雾困阵，又得九天玄女、龙族老祖应龙以及自己女儿女魃的帮助，终于击败了蚩尤的主力，并且一路追击到冀州之野，成功斩杀了蚩尤，自此五帝统治时期，人族再无内战爆发。
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